项目简介：针对于国内实验室的需求，以及针对不同的质谱仪器及其精度，运用各种算法，开发蛋白质组定量软件，包括标记定量方法和非标记定量方法，达到和超过国际上目前使用的软件精度和准确率。基于以上定量软件及其模块，开发出蛋白质定量软件和平台，成为国际上较有影响力的定量平台。 改进的ASAPRatio缺失值减少83.3%，运行速度提高约19倍；MZ-Analyzer 1.0beta,已在国际著名的SourceForge网站开源，累计下载210余次；QuantWiz软件包经上海生科院标准测试数据集初步测试，其定量精度接近或部分优于国际主流定量软件包Census；M-QuantWiz在16核加速比达到14.7，并行效率达到91.88%；P-QuantWiz在512核并行效率达到63.8%，具备了大规模并行的能力，扩展性良好。

产品性能：本成果完成了对国际主流蛋白质标记定量软件ASAPRatio精度和速度的改进；自主开发完成国产质谱数据可视化辅助分析软件MZ-Analyzer 1.0beta；设计与实现国产高性能蛋白质非标记定量原型软件包QuantWiz；设计与实现了QuantWiz多核并行版M-QuantWiz和MPI并行版P-QuantWiz。

应用行业：电子与信息

产业化前景分析:通过构建具有自主知识产权的蛋白质定量软件和软件平台，能够广泛的在国内的蛋白质组研究机构中得到应用，促进国内的蛋白质组研究，并对定量蛋白质组以后的发展趋势提供相应的软件支持，必将成为我国生物信息科学领域的重点研究对象。进而应用在制药、医疗诊断等领域，也对我国的经济和社会进步产生了推动作用。在国际上，能够成为具有一定影响力的蛋白质定量软件平台。在培育和扩展了本软件平台的国内外市场后，可以开展相应的咨询和培训等工作。因此具有广阔的市场前景和良好的经济、社会效益。

应用范围：生物信息科学领域，制药、医疗诊断等领域。